CGIのように実行する必要のあるファイルには、実行パーミッションを与える必要があります。
具体的には755(rwxr-xr-x)のパーミッションを推奨します。 CGI利用について

また、Perlチェッカーで記述されたCGIプログラムの文法チェックが行えます。
エラーが生じる場合は以下をご参照ください。 Perlチェッカーについて